Al acto, celebrado en Madrid, también asistió el ministro de Interior, Jorge Fernández Díaz, y los directivos del periódico La Vanguardia, que organizaba el evento.
El canciller aseguró que España está combatiendo y adaptando sus medios a las nuevas necesidades de ciberseguridad.
El mandatario no detalló a qué organismos se dirigieron los miles de ciberataques, pero sí reconoció que gran parte estaban dirigidos a diferentes órganos de la Administración Pública e incluso a empresas y particulares.
Ante estas repetidas amenazas, España creó en 2013 el Consejo Nacional y de la Estrategia Nacional de Ciberseguridad y elaboró un Plan Nacional de Ciberseguridad.
Sin embargo, Margallo aseguró que estas amenazas no son excusas para limitar las libertades de los ciudadanos.
El ministro denunció la "tentación de controlar" el espacio cibernético "con la excusa" de garantizar la protección de los ciudadanos.
"La pretensión de lograr así una mayor seguridad nacional puede ser comprensible, pero puede llevarnos a cometer errores fatales para el progreso humano", alertó el canciller.