"La frase de que el cierre de fronteras significaría el fracaso de Europa también puede interpretarse al contrario: no cerrar las fronteras, continuar como hasta ahora, pondría a Europa de rodillas", dijo Dobrindt en declaraciones al diario Münchner Merkur.
El ministro pidió a Merkel "enviar un mensaje claro: no todo el mundo que busca una vida mejor puede venir a Alemania".
"Mostrar al mundo una cara afable ha dejado de ser suficiente", insistió.
Dobrindt también acusó a Bruselas de haber abandonado a Alemania a su suerte en la crisis de refugiados.
"Quien habla de una 'coalición de voluntarios' para gestionar esta crisis también debería mencionar la realidad: que en esta cuestión hay desde hace tiempo una 'coalición de reacios' contra nosotros", afirmó el ministro.
Las críticas de Dobrindt llegan un día después de que los medios informasen de que una reunión de la cúpula de la Unión Demócrata Cristiana (CDU), el partido de Merkel, terminase con duras críticas hacia la canciller.
Anteriormente, 50 diputados de la CDU firmaron una carta de protesta contra la política de asilo de la canciller federal.
Las declaraciones de Dobrindt podrían ahondar en la división interna del partido de Merkel, cuya gestión de la crisis de refugiados se encuentra en entredicho, en particular tras los incidentes en Colonia.
Tema: Medidas de la UE sobre refugiados
Un reciente sondeo de Politbarometer para la segunda cadena de televisión pública (ZDF) indica que hasta un 60 por ciento de los alemanes cree que Alemania ha alcanzado el límite de sus capacidades y no debe acoger a más refugiados; se trata de un aumento de casi veinte puntos con respecto a diciembre, cuando un 46 por ciento suscribió esa afirmación.
Solo un 37 por ciento de los alemanes cree que el país puede seguir recibiendo a refugiados sin enfrentarse a problemas, cuando en diciembre la cifra era del 51 por ciento.
Además, un 56 por ciento de los encuestados opina que Merkel no está gestionando la crisis de refugiados correctamente, y solo la respalda ya un 39 por ciento.
Un 70 por ciento (62 por ciento en diciembre) consideró que la criminalidad crecería en el país debido a la llegada masiva de inmigrantes y refugiados, y un 42 por ciento que su presencia amenaza los valores culturales y sociales de Alemania (33 por ciento en diciembre).
Asimismo, un 73 por ciento se mostró a favor de endurecer las leyes de asilo del país.
El año pasado 1,1 millones de refugiados llegaron a Alemania.