Anteriormente se comunicó de 29 muertos, 27 de ellos fueron hallados de debajo de los escombros de un edificio de 17 plantas en la ciudad de Tainan.
Los socorristas trabajan a contrarreloj para encontrar a más de un centenar de desaparecidos bajo los escombros de otros edificios.
Un terremoto de magnitud 6,4 sacudió el viernes la parte austral de la isla de Taiwán.
El seísmo, que también dejó más de 500 heridos, se registró a las 19.57 GMT a 25 kilómetros al sur de la ciudad de Yujing, a una profundidad de 10 kilómetros.
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El presidente de China, Xi Jinping, expresó las condolencias a los parientes de las víctimas y prometió todo tipo de ayuda a la isla.