"El número total de los que llegaron de Turquía a la UE en 2019, actualmente es de 46.546", dice el informe.
Al mismo tiempo, casi 45.500 personas, en su mayoría afganos, sirios e iraquíes, se quedaron en Grecia.
Se señala que sólo 120 personas fueron devueltos a Turquía como parte del acuerdo entre la UE y Ankara en los primeros nueve meses de 2019.
"El ritmo de la operación de retorno de migrantes de Grecia a Turquía es críticamente lento", advierte el informe.
Se estima que unos 3,6 millones de refugiados se encuentran hoy en Turquía cuyo presidente, Recep Tayyip Erdogan, amenazó a principios de septiembre con abrir las compuertas ante una nueva oleada de migrantes a menos que la UE proporcione apoyo para realojarlos en una zona segura en el norte de Siria.