"La medida entrará en vigor desde la mañana del sábado 24 de abril", dijo Beaune al canal televisivo Franceinfo.
La autoridad indicó también que los viajeros procedentes de esos países tendrán que presentar un test PCR con resultado negativo a su llegada a Francia.
El país europeo suspendió el 14 de abril la comunicación aérea con Brasil hasta nuevo aviso para evitar la propagación de nuevas cepas del coronavirus.
El presidente Emmanuel Macron puso a Francia en confinamiento durante cuatro semanas desde el pasado 3 de abril para frenar los contagios en la tercera ola de la pandemia.
Francia es actualmente el principal foco de contagio en Europa con más de 5,2 millones de casos de coronavirus y más de 100.000 muertes por COVID-19.